Los vuelos directos a Mykonos aterrizan en el aeropuerto de Mykonos, ubicado a 4 km de la capital de la isla. Los vuelos directos durante el verano son muy frecuentes, mientras que durante el resto del año puede ser necesario hacer escala en Atenas.
Los vuelos directos para Miconos salendesde los aeropuertos de Madrid y Barcelona por a las aerolíneas Iberia y Vueling Airlines.
Iberia conecta Madrid y Miconos con vuelos directos al aeropuerto de Miconos.
Vueling Airlines es la única compañía que vuela directamente desde Barcelona a Miconos y aterriza en el aeropuerto de Miconos.
La compañia de bandera española Iberia vuela desde el aeropuerto de Madrid-Barajas a el aeropuerto de Miconos.