Tutti i voli per Samos atterrano all’Aeroporto Samos International, situato a soli 3 km dal centro di Pythagoreio e 14 km dal capoluogo dell’isola Vathy.
I voli diretti per Samos partono dagli aeroporti di Milano, Bologna, Venezia e Verona grazie alle compagnie aeree Neos Air, Blu-express e Volotea.
La compagnia Neos Air vola dagli aeroporti di Milano Malpensa e Verona Internazionale verso l'aeroporto di Samos.
La compagnia Blu-express vola dagli aeroporti di Milano Bergamo Orio al Serio e Bologna International verso l'aeroporto di Samos.
La compagnia lowcost spagnola Volotea vola dall'aeroporto di Venezia Marco Polo verso l'aeroporto di Samos.
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